باتوجه به صدور بخشنامه های متعدد و در اجرای بند ز تبصره ۶ قانون بودجه سال ۱۳۹۶، جدیدترین موارد تغییرات این قانون بدین شرح می باشد:
اشخاص حقیقی که صرفا به امر مشاوره مالیاتی مبادرت می نمایند از مالیات بر ارزش افزوده معاف هستند ( مستند به پاسخ مورخ ۱۸ اردیبهشت ۱۳۹۶ از جانب معاونت مالیات بر ارزش افزوده سازمان امورمالیاتی به یکی از اعضای جامعه مشاوران مالیاتی )
بموجب بند ۶ ماده ۱۲ ق.م.ا.ا ،صرفا کالاهای اهدایی بصورت بلاعوض به وزارتخانه ها، موسسات دولتی و نهادهای عمومی غیر دولتی با تایید هیات وزیران و در حوزه های علمیه با تایید حوزه گیرنده کالا معاف هستند . این معافیت قابل تسری به هدایایی نیست که فعالان اقتصادی در کنار محصولات فروش رفته به اشخاصی غیر از موارد مندرج در بند فوق عرضه می کنند. ( مستند به پاسخ مورخ ۵ مهر ۱۳۹۶ مدیرکل دفتر فنی و اعتراضات مودیان به مدیریت عامل شرکت داروسازان التیام )
معافیت مالیاتی آستان قدس رضوی و شرکتها و موسسات وابسته به آن از مالیات بر درآمد لغایت عملکرد سال ۱۳۹۵ موضوعیت دارد و از بابت مالیات بر ارزش افزوده کما فی السابق، معافیتی وجود ندارد ( مستند به بخشنامه شماره ۲۰۰/۹۶/۱۰۶ مورخ ۲۲ مهر ۱۳۹۶ )
صرف نقض اطلاعات صورتحساب فروش از جمله عدم درج کدپستی و سایر موارد مشابه منجر به عدم پذیرش اعتبار مالیاتی در نظام مالیات بر ارزش افزوده نمی گردد ( مستند به بخشنامه شماره ۲۰۰/۹۶/۱۱۰ مورخ ۲۹ مهر ۱۳۹۶ )
مالیات بر ارزش افزوده بر مابه التفاوت پرداختی (یارانه) دولت بابت فرآورده های نفتی ( اصلی) ، مانند : بنزین، نفت سفید، نفت کوره، نفت گاز و گاز مایع ، برای دوره های مالیاتی سال ۱۳۹۴ “شرکت ملی پالایش و پخش فراورده های نفتی” و “شرکت پالایش نفت” ، معاف می باشد ( مستند به بخشنامه مورخ ۲۰۰/۹۵/۶۲ مورخ ۲۸ آذر ۱۳۹۵ )
بسته بندى و خشک کردن و پوست گیرى محصولات کشاورزى از جمله چاى بعنوان فراورى حساب نشده و معاف می باشد ( بموجب برنامه ششم توسعه، قابل اجرا از اول فروردین ۱۳۹۶ )
خودروهای برقی-بنزینی ، موتورسیکلت و خودروهای الکتریکی تولید داخل از پرداخت مالیات بر ارزش افزوده معاف هستند ( مستند به بخشنامه شماره ۲۶۰/۹۶/۱۰۸ مورخ ۲۹ مهر ۱۳۹۶ )