به استناد مفاد ماده (12) قانون،
عرضه کالاها و ارائه خدمات مشخص شده در این ماده و همچنین واردات، از پرداخت
مالیات و عوارض معاف می‌باشند. این معافیت قابل تسری به نهاده‌ها و عوامل غ معاف
به کارگیری شده در تولید یا عرضه کالاها و خدمات معاف نبوده و عرضه کنندگان کالا
یا ارائه دهندگان خدمت معاف مکلف به پرداخت مالیات و عوارض نها‌ده‌های تولیدی
(کالا یا خدمت) خود می‌باشند. لیکن به موجب تبصره‌های (2) و (3) ماده (17) قانون،
مالیات و عوارض پرداختی بابت کالاها و خدمات معاف قابل استرداد نمی‌باشد و به
استناد تبصره (5) ماده یاد شده مالیات و عوارض پرداختی توسط عرضه کنندگان کالای
معاف یا ارائه دهندگان خدمات معاف، به عنوان هزینه قابل قبول موضوع قانون مالیات‌های
مستقیم تلقی می‌گردد.